主人公游城十代在前往決斗學(xué)院的入學(xué)考試途中，與傳說(shuō)的決斗者武藤游戲相遇，并接受了武藤游戲的一張卡片。但是十代最終遲到并錯(cuò)過(guò)了考試。為此十代懇求克洛諾斯教授讓他通過(guò)考試，并由此展開(kāi)了決斗者之路。